Denmark Akan Memusnahkan Seekor Kawanan Binatang – Pemerintah Denmark telah memerintahkan pemusnahan seluruh kawanan cerpelai yang dibudidayakan untuk menghentikan penyebaran SARS-CoV-2 setelah para ilmuwan menemukan strain virus yang bermutasi pada beberapa hewan. Jadi, apa ilmu di balik pemusnahan itu, dan apa artinya bagi kita semua?
SARS-CoV-2, virus yang menyebabkan COVID-19, hanyalah salah satu dari keluarga besar virus yang disebut Coronaviridae. Sudah diketahui umum bahwa virus korona dapat menginfeksi banyak spesies berbeda (inangnya). Anggota Coronaviridae yang ditemukan di karnivora, hewan pengerat, ungulata (mamalia dengan kuku) dan bahkan burung. Karena SARS-CoV-2, sekarang anggota keluarga yang paling terkenal, telah menular dengan mudah ke populasi manusia, menemukan virus yang muncul di spesies lain bukanlah hal yang mengejutkan. idn play
Studi laboratorium telah menunjukkan bahwa SARS-CoV-2 dapat menginfeksi monyet, kucing, musang, kelinci, rubah, dan hamster. Dan pendekatan komputasi telah memperkirakan bahwa host yang lebih luas lagi mungkin rentan.
Sementara istilah “zoonosis” – digunakan untuk mendefinisikan penularan dari hewan ke manusia – secara luas dikenal, istilah yang kurang umum digunakan adalah “infeksi antroponotik”, yang menjelaskan ketika manusia mengembalikan patogen ke spesies hewan. Tetapi jelas bahwa penularan dari manusia ke hewan terjadi pada banyak patogen zoonosis – dan SARS-CoV-2 tidak terkecuali. Genom SARS-CoV-2 kini telah diisolasi dari infeksi alami pada anjing, kucing, bahkan singa dan harimau kebun binatang. Jumlah genom dari reservoir hewan diperkirakan akan meningkat.
Pada awal April, saat memerangi gelombang pertama SARS-CoV-2 di seluruh Eropa, infeksi SARS-CoV-2 di cerpelai dilaporkan di Belanda. Di peternakan cerpelai Belanda, cerpelai dalam jarak dekat menyediakan tempat berkembang biak bagi SARS-CoV-2 untuk ditularkan, dan banyak hewan mulai menunjukkan gejala pernapasan ringan hingga parah. Pada 23 April, infeksi SARS-CoV-2 dikonfirmasi tidak hanya di cerpelai tetapi juga pada pekerja pertanian, menunjukkan SARS-CoV-2 melompat kembali melintasi penghalang spesies sekali lagi.
Kucing liar di peternakan ini juga ditemukan memiliki antibodi untuk SARS-CoV-2. Saat para penyelidik menulis temuan mereka, sembilan peternakan cerpelai lainnya menunjukkan wabah serupa. Pada 3 Juni, Kementerian Pertanian Belanda mengumumkan pemusnahan semua cerpelai dari peternakan yang terinfeksi.
Situasi di Belanda hanyalah permulaan. Saat SARS-CoV-2 menyerang manusia dengan keras dan cepat, virus menyebar ke populasi cerpelai. Wabah selanjutnya menyusul di Spanyol, Swedia, Italia, AS dan Denmark. Jelas SARS-CoV-2 mentransmisikan dengan baik di cerpelai, dan dengan kasus penularan kembali ke pekerja pertanian cerpelai lebih lanjut pemusnahan diperlukan.
Genom yang dihasilkan dari virus SARS-CoV-2 yang diambil sampelnya selama peristiwa ini mendukung banyak masuknya SARS-CoV-2 dari manusia yang terinfeksi ke populasi cerpelai dengan garis keturunan virus yang sangat berbeda yang beredar di peternakan yang berbeda.
Laporan terbaru tentang wabah yang meluas di peternakan cerpelai Denmark di North Jutland bukanlah hal baru. Tetapi dengan semakin banyaknya bukti infeksi cerpelai yang menyebar ke komunitas manusia (WHO melaporkan 214 kasus terkait manusia), pemusnahan yang sekarang diberlakukan di Denmark sayangnya merupakan intervensi yang diperlukan untuk menahan penularan.
Tapi apakah itu berbahaya?
Laporan dari Denmark telah disertai dengan klaim mutasi baru dan berbahaya yang timbul dalam subset cerpelai SARS-CoV-2 yang kembali ke sirkulasi manusia. Tetapi tidak ada bukti hingga saat ini bahwa infeksi COVID-19 pada manusia yang terkait dengan industri cerpelai berbeda dalam presentasi atau tingkat keparahannya.
Mutasi adalah bagian alami dari evolusi virus dan sebagian besar diharapkan tidak berdampak. Sama seperti SARS-CoV-2 bermutasi selama penularan manusia, hal yang sama berlaku untuk cerpelai – atau memang pada hewan lain yang menginfeksi SARS-CoV-2.
Para peneliti dengan penuh semangat menunggu pelepasan genom yang dihasilkan dari peternakan cerpelai di Jutlandia Utara dan semua bukti yang menyertai untuk mempelajari lebih lanjut dan mengkarakterisasi kemungkinan dampaknya. Laporan pers secara khusus berfokus pada empat perubahan yang terlihat pada protein lonjakan – bagian dari SARS-CoV-2 yang mengunci sel reseptor inang yang memungkinkan virus masuk. Virus yang membawa serangkaian perubahan spesifik yang terlihat pada beberapa infeksi cerpelai telah diidentifikasi dalam beberapa kasus manusia, yang dikenal sebagai “cluster 5”.
Tetapi dampak fungsional dari mutasi yang dilaporkan di Jutlandia Utara belum dipahami dengan baik. Mutasi pada lonjakan protein SARS-CoV-2 tidak jarang terjadi. Kami telah melihat mereka sebelumnya dan beberapa telah mencapai frekuensi tinggi. Pada saat yang sama, perubahan motif pengikatan spesifik dari protein ini, baik yang muncul pada manusia atau cerpelai, berpotensi mengubah pengenalan oleh sistem kekebalan, dengan kemungkinan implikasi untuk penghindaran vaksin.
Perubahan yang tidak terkait di wilayah SARS-CoV-2 ini juga telah diidentifikasi pada kasus manusia dan sedang dipelajari dan dipantau dengan cermat. Untuk saat ini, kita harus diyakinkan bahwa mutasi ini, dan yang teridentifikasi di cerpelai, masih sangat jarang terjadi pada manusia. Laporan terbaru menunjukkan cluster 5 sudah punah.
Pada saat yang sama, mutasi pada cerpelai mungkin menawarkan tanda penting tentang bagaimana SARS-CoV-2 beradaptasi untuk menginfeksi inang baru. Kami mungkin melewatkan jendela peluang ini ketika datang ke lompatan SARS-CoV-2 ke dalam sirkulasi manusia menjelang paruh kedua tahun 2019. Sekarang data genomik dari infeksi mink farm menyediakan siaran langsung yang menampilkan apa yang terjadi ketika SARS-CoV-2 masuk dan ditransmisikan di host baru. Mungkin ada banyak pelajaran berharga yang didapat dari mempelajari pertemuan semacam itu.